Организационно-методический отдел был создан в 1992 году и первоначально имел название планово-экономический отдел. Его заведующей была назначена Мария Васильевна Белогур, до этого работающая экспертом химического отделения бюро.

М.В. Белогур
заведующая отделом с1992г. по 2001г.

С 2001 года отделом заведовал Руднев Фёдор Иванович, врач судебно-медицинский эксперт высшей квалификационной категории, с большим стажем и опытом экспертной работы.

.

Ф.И. Руднев
заведующий отделом с 2001г. по 2010г

В 2006 году планово-экономический отдел был переименован в организационно-методический отдел.

В 2010 году отдел возглавила Белозёрова Марина Николаевна, эксперт судебно-химического отделения первой квалификационной категории.

С 2012 года в структуру отдела входит отделение программно-технического обеспечения и информационной безопасности. Отделение было создано в 2007г. Заведующий отделением — Шпанер М.А. С января 2010 года в отделение программно-технического обеспечения добавились задачи по обеспечению безопасности информации.